Departamento de Ciencias Médicas y Quirúrgicashttp://hdl.handle.net/10396/1202024-03-29T13:29:05Z2024-03-29T13:29:05ZMarcadores proteómicos de respuesta a fármacos anti-TNF en pacientes con enfermedad inflamatoria intestinalMedina Medina, Rosariohttp://hdl.handle.net/10396/275282024-02-21T03:01:05Z2023-01-01T00:00:00ZMarcadores proteómicos de respuesta a fármacos anti-TNF en pacientes con enfermedad inflamatoria intestinal
Medina Medina, Rosario
La Enfermedad Inflamatoria Intestinal (EII) abarca una serie de patologías crónicas, caracterizadas por desarrollar una inflamación a nivel intestinal. Las dos patologías más representativas de la EII son la Enfermedad de Crohn (EC) y la Colitis Ulcerosa (CU). En los últimos 50 años, su prevalencia en países industrializados ha incrementado hasta los 120–200 casos anuales por cada 100,000 habitantes. En España, la incidencia actual es similar a la de otros países europeos, con aproximadamente 16 casos por cada 100.000 habitantes y año. Se trata de patologías de origen no totalmente conocido, en las que interviene una combinación de factores genéticos, inmunológicos y ambientales, necesarios para desencadenar los síntomas a los que se asocian. Al ser una patología crónica, el objetivo del tratamiento médico es reducir la inflamación que se produce y recuperar la integridad de la mucosa intestinal. Históricamente se han usado tratamientos como corticoides e inmunosupresores para el tratamiento de la EII, pero el desarrollo de las terapias biológicas abrió un nuevo campo en la farmacoterapia de estas patologías. Los primeros fármacos biológicos aprobados para la EII fueron los anti-TNF o inhibidores del factor de necrosis tumoral, en el año 2000. Pese a su eficacia para inducir la remisión de la enfermedad, un 30-50% de los pacientes tratados no responden inicialmente al tratamiento biológico, y hasta un tercio de los pacientes que sí lo hacen pueden perder la respuesta al fármaco a lo largo del seguimiento.v En este trabajo de tesis nos propusimos identificar biomarcadores de predicción de respuesta al tratamiento biológico con objeto de optimizar el uso de la terapia anti-TNF en pacientes con EII, evitando el desarrollo de efectos secundarios adversos asociados y favoreciendo un mejor aprovechamiento de los recursos del sistema sanitario público. En primer lugar, reclutamos de manera prospectiva dos cohortes independientes de pacientes con EC o con CU, que no hubieran sido tratados previamente con terapia biológica anti-TNF. A los pacientes incluidos voluntariamente en el estudio, se les extrajo una muestra de sangre antes del inicio del tratamiento y se les realizó un seguimiento clínico durante los 12 meses posteriores al mismo. Durante el seguimiento, se evaluaron diferentes parámetros clínicos y se clasificó a los pacientes como respondedores/no respondedores a los 3 meses (corto plazo; grupos STR/NSTR, respectivamente) o a los 12 meses (largo plazo, grupos LTR/NLTR, respectivamente) del comienzo del tratamiento. Una vez clasificados los pacientes, se seleccionó aleatoriamente un número representativo de cada grupo para analizar el perfil proteómico de los mismos mediante SWATH. Para la EC, identificamos como factores clínicos de respuesta primaria al tratamiento (a corto plazo, STR): la edad y el diagnóstico reciente. Como factores de no respuesta primaria (NSTR) identificamos: el tratamiento con corticoides durante la inducción de la enfermedad, la resección intestinal previa y el índice de actividad de la enfermedad (CDAI) basal elevado. En el análisis proteómico de las muestras de plasma, identificamos un total de 14 proteínas con expresión diferencial entre ambos grupos de pacientes STR y NSTR (≥2,4 veces y significación estadística por prueba t con p≤0,01), como potenciales biomarcadores de respuesta primaria al tratamiento biológico. Estas proteínas se relacionaron con la hemostasia, la función plaquetaria, el citoesqueleto celular, la respuesta inflamatoria y la glucólisis. En base a sus valores de expresión diferencial, las proteínas enolasa 1 (alfa-enolasa o ENOA) y vinculina (VINC) fueron validadas en una cohorte de 113 pacientes con EC mediante ELISA. A partir de los valores obtenidos en este ensayo, solamente VINC aportó valor al modelo de predicción de respuesta generado a partir de las variables clínicas seleccionadas (corticoides en la inducción, resección intestinal previa y CDAI basal) (AUC (95% IC)=0.919 (0.862-0.977), p<0.000). Cuando comparamos los valores de VINC entre los pacientes con respuesta mantenida y aquellos con pérdida de respuesta a los 12 meses, observamos que estos eran significativamente más altos en el grupo de pacientes con respuesta a largo plazo (NLTR: 0,8 (0,2-1,5) vs LTR: 1,2 (0,8-2,1); p=0,038). No obstante, aunque la concentración plasmática basal de VINC añadió valor al modelo multivariante de predicción a largo plazo, la capacidad discriminante de dicho modelo fue discreta (AUC (IC 95%)=0,696 (0,592-0,800), p<0.001). En el caso de los pacientes con CU, no pudimos identificar ninguna variable clínica relacionada con la respuesta al tratamiento biológico, posiblemente debido al tamaño muestral. En el análisis proteómico, manteniendo los mismos parámetros definidos anteriormente para la EC, seleccionamos un total de 10 proteínas como biomarcadores candidatos de STR, relacionadas con la fase aguda, el sistema del complemento, la inmunidad innata, el transporte y el mantenimiento del epitelio intestinal. En este caso, no pudimos validar ninguna de ellas al no disponer de una cohorte suficiente de pacientes. En resumen, la proteómica SWATH resultó una técnica válida para identificar potenciales marcadores de respuesta al tratamiento anti-TNF. El uso de estos biomarcadores candidatos en combinación con parámetros clínicos relacionados con la enfermedad podría resultar útil para identificar a los pacientes con EII que pueden beneficiarse de los fármacos anti-TNF, antes de comenzar la terapia. Ello evitaría el desarrollo de efectos secundarios indeseables y permitiría a los pacientes beneficiarse de tratamientos de segunda línea más eficaces, mejorando su calidad de vida y optimizando el uso de los recursos médicos.
2023-01-01T00:00:00ZGenetic landscape of Segawa disease in Spain. Long-term treatment outcomesFernández Ramos, Joaquín AlejandroTorre‑Aguilar, M. J. de laQuintáns, BeatrizPérez Navero, Juan LuisBeyer, KatrinLópez-Laso, Eduardohttp://hdl.handle.net/10396/274312024-02-13T03:01:27Z2021-01-01T00:00:00ZGenetic landscape of Segawa disease in Spain. Long-term treatment outcomes
Fernández Ramos, Joaquín Alejandro; Torre‑Aguilar, M. J. de la; Quintáns, Beatriz; Pérez Navero, Juan Luis; Beyer, Katrin; López-Laso, Eduardo
Introduction
In 2009, we described a possible founder effect of autosomal dominant Segawa disease in Córdoba (Spain) due to mutation c.265C>T (p. Q89*) in the GCH1 gene. We present a retrospective multicentre study aimed at improving our knowledge of Segawa disease in Spain and providing a detailed phenotypic-genotypic description of patients.
Methods
Clinical-genetic information were obtained from standardized questionnaires that were completed by the neurologists attending children and/or adults from 16 Spanish hospitals.
Results
Eighty subjects belonging to 24 pedigrees had heterozygous mutations in GCH1. Seven genetic variants have been described only in our cohort of patients, 5 of which are novel mutations. Five families not previously described with p. Q89* were detected in Andalusia due to a possible founder effect. The median latency to diagnosis was 5 years (IQR 0–16). The most frequent signs and/or symptoms were lower limb dystonia (38/56, 67.8%, p = 0.008) and diurnal fluctuations (38/56, 67.8%, p = 0.008). Diurnal fluctuations were not present in the phenotypes other than dystonia. Fifty-three of 56 symptomatic patients were treated with a levodopa/decarboxylase inhibitor for (mean ± SD) 12.4 ± 8.12 years, with 81% at doses lower than 350 mg/day (≤5 mg/kg/d in children). Eleven of 53 (20%) patients had nonresponsive symptoms that affected daily life activities. Dyskinesias (4 subjects) were the most prominent adverse effects.
Conclusion
This study identifies 5 novel mutations and supports the hypothesis of a founder effect of p. Q89* in Andalusia. New insights are provided for the phenotypes and long-term treatment responses, which may improve early recognition and therapeutic management.
Embargado hasta 12/02/2044
2021-01-01T00:00:00ZThe Metabolic Impact of Two Different Parenteral Nutrition Lipid Emulsions in Children after Hematopoietic Stem Cell Transplantation: A Lipidomics InvestigationRangel-Huerta, Oscar DanielTorre‑Aguilar, M. J. de laMesa, María DoloresFlores Rojas, Katherine UbinaPérez Navero, Juan LuisBaena-Gómez, María AuxiliadoraGil, ÁngelGil Campos, Mercedeshttp://hdl.handle.net/10396/274252024-02-13T03:01:23Z2022-01-01T00:00:00ZThe Metabolic Impact of Two Different Parenteral Nutrition Lipid Emulsions in Children after Hematopoietic Stem Cell Transplantation: A Lipidomics Investigation
Rangel-Huerta, Oscar Daniel; Torre‑Aguilar, M. J. de la; Mesa, María Dolores; Flores Rojas, Katherine Ubina; Pérez Navero, Juan Luis; Baena-Gómez, María Auxiliadora; Gil, Ángel; Gil Campos, Mercedes
Hematopoietic stem cell transplantation (HSCT) involves the infusion of either bone marrow or blood cells preceded by toxic chemotherapy. However, there is little knowledge about the clinical benefits of parenteral nutrition (PN) in patients receiving high-dose chemotherapy during HSCT. We investigated the lipidomic profile of plasma and the targeted fatty acid profiles of plasma and erythrocytes in children after HSCT using PN with either a fish oil-based lipid emulsion or a classic soybean oil emulsion. An untargeted liquid chromatography high-resolution mass spectrometry platform connected with a novel in silico annotation algorithm was utilized to determine the most relevant chemical subclasses affected. In addition, we explored the interrelation between the lipidomics profile in plasma, the targeted fatty acid profile in plasma and erythrocytes, several biomarkers of inflammation, and antioxidant defense using an innovative data integration analysis based on Latent Components. We observed that the fish oil-based lipid emulsion had an impact in several lipid subclasses, mainly glycerophosphocholines (PC), glycerophosphoserines (PS), glycerophosphoethanolamines (PE), oxidized PE (O-PE), 1-alkyl,2-acyl PS, lysophosphatidylethanolamines (LPE), oxidized PS (O-PS) and dicarboxylic acids. In contrast, the classic soybean oil emulsion did not. Several connections across the different blocks of data were found and aid in interpreting the impact of the lipid emulsions on metabolic health.
2022-01-01T00:00:00ZAnalysis of Global and Local DNA Methylation Patterns in Blood Samples of Patients With Autism Spectrum DisorderGarcía-Ortiz, M.V.Torre‑Aguilar, M. J. de laMorales-Ruiz, T.Gómez Fernández, Antonio RafaelFlores Rojas, Katherine UbinaGil Campos, MercedesMartín-Borreguero, PilarAriza, Rafael R.Roldán-Arjona, TeresaPérez Navero, Juan Luishttp://hdl.handle.net/10396/274242024-02-13T03:01:12Z2021-01-01T00:00:00ZAnalysis of Global and Local DNA Methylation Patterns in Blood Samples of Patients With Autism Spectrum Disorder
García-Ortiz, M.V.; Torre‑Aguilar, M. J. de la; Morales-Ruiz, T.; Gómez Fernández, Antonio Rafael; Flores Rojas, Katherine Ubina; Gil Campos, Mercedes; Martín-Borreguero, Pilar; Ariza, Rafael R.; Roldán-Arjona, Teresa; Pérez Navero, Juan Luis
The goal of this investigation was to determine whether there are alterations in DNA methylation patterns in children with autism spectrum disorder (ASD).
Material and Methods: Controlled prospective observational case-control study. Within the ASD group, children were sub-classified based on the presence (AMR subgroup) or absence (ANMR subgroup) of neurodevelopmental regression during the first 2 years of life. We analyzed the global levels of DNA methylation, reflected in LINE-1, and the local DNA methylation pattern in two candidate genes, Neural Cell Adhesion Molecule (NCAM1) and Nerve Growth Factor (NGF) that, according to our previous studies, might be associated to an increased risk for ASD. For this purpose, we utilized blood samples from pediatric patients with ASD (n = 53) and their corresponding controls (n = 45).
Results: We observed a slight decrease in methylation levels of LINE-1 in the ASD group, compared to the control group. One of the CpG in LINE-1 (GenBank accession no.X58075, nucleotide position 329) was the main responsible for such reduction, highly significant in the ASD subgroup of children with AMR (p < 0.05). Furthermore, we detected higher NCAM1 methylation levels in ASD children, compared to healthy children (p < 0.001). The data, moreover, showed higher NGF methylation levels in the AMR subgroup, compared to the control group and the ANMR subgroup. These results are consistent with our prior study, in which lower plasma levels of NCAM1 and higher levels of NGF were found in the ANMR subgroup, compared to the subgroup that comprised neurotypically developing children.
Conclusions: We have provided new clues about the epigenetic changes that occur in ASD, and suggest two potential epigenetic biomarkers that would facilitate the diagnosis of the disorder. We similarly present with evidence of a clear differentiation in DNA methylation between the ASD subgroups, with or without mental regression.
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