Integrated control of avocado white root rot through biological and chemical methods

Abstract

Spain is the highest avocado producer country in the European Union. White root rot caused by the ascomycete Rosellinia necatrix is one of the most important diseases of this crop in the southern coastal area of Iberian Peninsula due to its difficult management. We studied different integrated control methods of this disease and its possible combinations. First, we detected and identified mycoviruses in R. necatrix isolates and their relation with the hypovirulence factor as a future virocontrol method. As well we obtained novel antagonistic fungi (Entoleuca sp. isolates) in which we analyzed mycoviruses presence, their growth under different temperatures, their vegetative compatibility groups and their biocontrol effect against the disease. We improved a qPCR technique for the detection and quantification of this pathogen from avocado orchards soil samples, thus we used this novel technique to assess the inoculum quantity of R. necatrix in the soil after the treatments of the fungicide fluazinam that we carried out in commercial orchards. Furthermore we performed an integrated control of this disease combining low concentrations of fluazinam with antagonist organisms such as rhizobacteria strains and/or non-pathogenic R. necatrix isolates. In this work we have studied all possible chemical and biological control methods against this disease nowadays, even some of them can be applied directly in field conditions.

España es el mayor productor de aguacate en la Unión Europea. La podredumbre blanca radicular causada por el hongo ascomiceto Rosellinia necatrix Prill. es una de las enfermedades más importantes de este cultivo en la zona costera sur de la península Ibérica por su difícil manejo. Estudiamos diferentes métodos de control integrado de esta enfermedad y sus posibles combinaciones. Primero detectamos e identificamos micovirus infectando aislados de R. necatrix y su relación con el factor de hipovirulencia como un futuro método de virocontrol. También obtuvimos novedosos hongos antagonistas (aislados de Entoleuca sp.) en los que analizamos la presencia de micovirus, su crecimiento a diferentes temperaturas, sus grupos de compatibilidad vegetativa y su efecto de biocontrol contra la enfermedad. Mejoramos una técnica de qPCR para la detección y cuantificación de este patógeno en suelo a partir de muestras procedentes de fincas de aguacate, que fue utilizada como novedosa técnica para evaluar la cantidad de inóculo de R. necatrix presente en el suelo tras los tratamientos del fungicida fluazinam que realizamos en fincas comerciales para el control de la enfermedad. Además realizamos un control integrado de esta, combinando dosis bajas de fluazinam con organismos antagonistas como cepas de rizobacterias y/o aislados no patogénicos de R. necatrix. En este trabajo se han estudiado todos los posibles métodos de controles biológicos y químicos utilizables contra esta enfermedad hoy en día, pudiendo ser alguno de ellos de aplicación inmediata en campo.